Analise molecular e de correlação entre genotipo e fenotipo em epilepsias idiopaticas na infancia
Marina Coelho Gonsale
DISSERTAÇÃO
Português
T/UNICAMP G588a
[Molecular and genotype-phenotype correlation analysis in childhood idiophatic epilepsies]
Campinas, SP : [s.n.], 2009.
90 f. : il.
Orientador: Iscia Lopes Cendes
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas
Resumo: Dentre as epilepsias infantis, destacam-se a epilepsia mioclônica grave da infância (EMGI) e a epilepsia mioclônico-astática (EMA), as quais constituem os fenótipos mais graves do espectro da epilepsia generalizada com crises febris plus (EGCF+). Outra síndrome epiléptica importante é a...
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Resumo: Dentre as epilepsias infantis, destacam-se a epilepsia mioclônica grave da infância (EMGI) e a epilepsia mioclônico-astática (EMA), as quais constituem os fenótipos mais graves do espectro da epilepsia generalizada com crises febris plus (EGCF+). Outra síndrome epiléptica importante é a epilepsia benigna da infância com espículas centro- temporais (EBIECT), que se destaca por ser a mais comum na infância. Avanços nos estudos de genética molecular levaram à descoberta de um gene responsável pelo espectro de fenótipos da EGCF+, o gene SCN1A, e um locus candidato para EBIECT na região 15q14. Os objetivos deste projeto foram realizar triagem de mutações em genes candidatos em pacientes com as epilepsias mencionadas e estabelecer possíveis correlações genótipo- fenótipo. Os genes estudados foram o SCN1A para EMGI e EMA e os genes CHRM5, CHRNA7 e CX36, localizados na região cromossômica 15q14, para EBIECT. A triagem de mutações foi realizada por meio da técnica de Denaturing High Performance Liquid Chromatography (DHPLC) e posterior sequenciamento automático dos fragmentos alterados. Foram estudados nove pacientes com EMGI, 12 com EMA e 27 com EBIECT. A análise de mutações no gene SCN1A revelou seis alterações potencialmente deletérias: as substituições c.829T>C, c.971A>C e c.5434T>C, que resultam em troca de resíduo de aminoácidos na proteína codificada, a inserção c.3719_3720insGATA, que promove alteração na matriz de leitura, e as alterações IVS4+1G>A e IVS8+3G>T, que se localizam em possíveis sítios doadores de splicing. As alterações foram encontradas apenas em pacientes com o fenótipo mais grave, a EMGI, nos quais ocorreram crises em vigência de febre baixa. A análise de mutações nos pacientes com EBIECT não revelou alterações potencialmente deletérias nos genes estudados. Com base nos resultados deste trabalho, podemos concluir que pelo fato de variantes potencialmente deletérias terem sido encontradas no gene SCN1A apenas em pacientes com EMGI, isso levanta a hipótese de que outro gene esteja envolvido na etiologia de EMA nos demais pacientes. O gene CHRM5 não parece estar envolvido com a etiologia de EBIECT em nossa amostra de pacientes. Também não foram encontradas alterações potencialmente deletérias nos genes CHRNA7 e CX36, mas os mesmos ainda não podem ser totalmente excluídos como envolvidos em EBIECT.
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Abstract: Among the childhood epilepsies one important sub-group is the spectrum of generalized epilepsy with febrile seizures plus (GEFS+), which includes severe syndromes such as severe myoclonic epilepsy of infancy (SMEI) and myoclonic astatic epilepsy (MAE). Another important epileptic syndrome...
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Abstract: Among the childhood epilepsies one important sub-group is the spectrum of generalized epilepsy with febrile seizures plus (GEFS+), which includes severe syndromes such as severe myoclonic epilepsy of infancy (SMEI) and myoclonic astatic epilepsy (MAE). Another important epileptic syndrome is benign childhood epilepsy with centrotemporal spikes (BCECTS), which is of particular interest for being the most common childhood epilepsy. Advances in molecular genetic studies led to the discovery of the SCN1A gene, responsible for the spectrum of GEFS+, and a candidate locus for BCECTS in the 15q14 region. The main objectives of this project were to screen candidate genes for mutations in a cohort of patients diagnosed with the epilepsies mentioned above, and to established genotype-phenotype correlations. We studied the SCN1A gene in patients with SMEI and MAE; and CHRM5, CHRNA7, and CX36 genes, located within the candidate region on chromosome 15q14, in patients with BCECTS. Mutation screening was performed using the denaturing high performance liquid chromatography (DHPLC) technique, with subsequent automatic sequencing of the altered fragments. We investigated 9 patients with SMEI, 12 with MAE and 27 with BCECTS. Analysis of the SCN1A gene revealed 6 potentially deleterious variants: substitutions
c.829T>C, c.971A>C and c.5434T>C, leading to amino acid residue substitutions; insertion c.3719_3720insGATA, which promotes a frameshift; and alterations IVS4+1G>A and IVS8+3G>T, which possibly modify splicing donor sites. We found alterations only in patients with the most severe phenotype, SMEI, who had seizures during low temperature fever occur. Mutation analysis in patients diagnosed with BCECTS did not reveal potentially deleterious variants for the genes studied. As a result of our study, we can conclude that we only found potentially deleterious variants in the SCN1A gene among the patients studied. The fact that they were identified only in patients with SMEI provides evidence that another gene is likely to be involved in the etiology of MAE. The CHRM5 gene does not seem to be involved in the etiology of BCECTS in our patients. Even though no evidences supporting the pathologic role of CHRNA7 and CX36 genes were found, we still can not exclude them as involved in BCECTS. Ver menos
c.829T>C, c.971A>C and c.5434T>C, leading to amino acid residue substitutions; insertion c.3719_3720insGATA, which promotes a frameshift; and alterations IVS4+1G>A and IVS8+3G>T, which possibly modify splicing donor sites. We found alterations only in patients with the most severe phenotype, SMEI, who had seizures during low temperature fever occur. Mutation analysis in patients diagnosed with BCECTS did not reveal potentially deleterious variants for the genes studied. As a result of our study, we can conclude that we only found potentially deleterious variants in the SCN1A gene among the patients studied. The fact that they were identified only in patients with SMEI provides evidence that another gene is likely to be involved in the etiology of MAE. The CHRM5 gene does not seem to be involved in the etiology of BCECTS in our patients. Even though no evidences supporting the pathologic role of CHRNA7 and CX36 genes were found, we still can not exclude them as involved in BCECTS. Ver menos
Lopes-Cendes, Íscia Teresinha, 1964-
Orientador
Cendes, Iscia Teresinha Lopes, 1964-
Orientador
Manreza, Maria Luiza Giraldes de
Avaliador
Lopes, Vera Lúcia Gil da Silva, 1967-
Avaliador
Analise molecular e de correlação entre genotipo e fenotipo em epilepsias idiopaticas na infancia
Marina Coelho Gonsale
Analise molecular e de correlação entre genotipo e fenotipo em epilepsias idiopaticas na infancia
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