Desenvolvimento de marcadores moleculares microssatelites, mapeamento genetico e mapeamento de caracteristicas qualitativas em feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.)
Tatiana de Campos
TESE
Português
T/UNICAMP C157d
[Development of microsatellite markers, genetic mapping and qualitative characteristcs mapping in common bean (Phaseolus vulgaris L.)]
Campinas, SP : [s.n.], 2009.
120 p. : il.
Orientadores: Anete Pereira de Souza, Luciana Lasry Benchimol
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Resumo: O melhoramento genetico do feijoeiro busca responder ou atender
demandas especificas dos produtores. Um cultivar de feijoeiro deve atender as
caracteristicas de produtividade, de resistencia as principais doencas da cultura, e
de qualidade tecnologicas, tais como tempo de cozimento,... Ver mais Resumo: O melhoramento genetico do feijoeiro busca responder ou atender
demandas especificas dos produtores. Um cultivar de feijoeiro deve atender as
caracteristicas de produtividade, de resistencia as principais doencas da cultura, e
de qualidade tecnologicas, tais como tempo de cozimento, qualidades nutricionais
e tipo de caldo. A escolha de criterios racionais e eficientes para a identificacao de
linhagens superiores a serem utilizadas em cruzamentos facilita o trabalho do
melhorista. Alem disso, a escolha dos genitores com maior potencial genetico para
recombinacao aumenta as chances de obtencao de cultivares mais produtivos e
estaveis para o comercio, bem como facilita a selecao dos genotipos nos ensaios de
competicao. O feijoeiro e uma das culturas de destaque no Brasil com potencial a ser
explorado e requer esforcos para o manejo adequado. Neste sentido, o
investimento em tecnicas moleculares pode ser associado ao auxilio no
melhoramento classico, como para a realizacao de programas de selecao assistida
por marcadores. Os microssatelites sao marcadores moleculares definidos por
sequencias repetitivas abundantes nos genomas de eucariotos, transferiveis e
informativas. Os microssatelites sao marcadores amplamente utilizados em
estudos geneticos e no desenvolvimento de mapas geneticos.
Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de marcadores
moleculares do tipo microssatelites para feijoeiro para a construcao de um mapa
genetico molecular. Foram desenvolvidos 488 novos microssatelites, sendo que
183 estao disponiveis em 3 publicacoes sobre caracterizacao destes locos e, 64
estao descritos no artigo referente ao mapa genetico. Os demais locosapresentaram-se monomorficos dentre os genotipos utilizados, mas tambem serao
divulgados na forma de manuscrito. O mapa genetico foi estabelecido com base em uma populacao F10 segregante, composta de 380 linhagens endogamicas, derivadas do cruzamento entre IAC-UNA e CAL143. Foram analisados no total 871 microssatelites, entre eles 265 (30,4%) foram polimorficos e 247 (28,4%) apresentaram padrao adequado de
leitura de genotipagem. Para a construcao do mapa, alem dos marcadores
moleculares, foram utilizados tres marcadores fenotipicos: cor de flor, formato do
apice da vagem e habito de crescimento. Foi possivel mapear 198 microssatelites e
os 3 marcadores fenotipicos. Dentre os marcadores mapeados, 131 tinham a
posicao ate entao desconhecida em grupos de ligacao. O mapa resultante cobre
1865.9 cM, com uma distancia media entre marcadores de 9.4 cM. A cobertura de
mapa e considerada de saturacao moderada e pode servir de base para o
mapeamento de outras caracteristicas fenotipicas e de QTLs.
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demandas especificas dos produtores. Um cultivar de feijoeiro deve atender as
caracteristicas de produtividade, de resistencia as principais doencas da cultura, e
de qualidade tecnologicas, tais como tempo de cozimento,... Ver mais Resumo: O melhoramento genetico do feijoeiro busca responder ou atender
demandas especificas dos produtores. Um cultivar de feijoeiro deve atender as
caracteristicas de produtividade, de resistencia as principais doencas da cultura, e
de qualidade tecnologicas, tais como tempo de cozimento, qualidades nutricionais
e tipo de caldo. A escolha de criterios racionais e eficientes para a identificacao de
linhagens superiores a serem utilizadas em cruzamentos facilita o trabalho do
melhorista. Alem disso, a escolha dos genitores com maior potencial genetico para
recombinacao aumenta as chances de obtencao de cultivares mais produtivos e
estaveis para o comercio, bem como facilita a selecao dos genotipos nos ensaios de
competicao. O feijoeiro e uma das culturas de destaque no Brasil com potencial a ser
explorado e requer esforcos para o manejo adequado. Neste sentido, o
investimento em tecnicas moleculares pode ser associado ao auxilio no
melhoramento classico, como para a realizacao de programas de selecao assistida
por marcadores. Os microssatelites sao marcadores moleculares definidos por
sequencias repetitivas abundantes nos genomas de eucariotos, transferiveis e
informativas. Os microssatelites sao marcadores amplamente utilizados em
estudos geneticos e no desenvolvimento de mapas geneticos.
Este trabalho teve como objetivo o desenvolvimento de marcadores
moleculares do tipo microssatelites para feijoeiro para a construcao de um mapa
genetico molecular. Foram desenvolvidos 488 novos microssatelites, sendo que
183 estao disponiveis em 3 publicacoes sobre caracterizacao destes locos e, 64
estao descritos no artigo referente ao mapa genetico. Os demais locosapresentaram-se monomorficos dentre os genotipos utilizados, mas tambem serao
divulgados na forma de manuscrito. O mapa genetico foi estabelecido com base em uma populacao F10 segregante, composta de 380 linhagens endogamicas, derivadas do cruzamento entre IAC-UNA e CAL143. Foram analisados no total 871 microssatelites, entre eles 265 (30,4%) foram polimorficos e 247 (28,4%) apresentaram padrao adequado de
leitura de genotipagem. Para a construcao do mapa, alem dos marcadores
moleculares, foram utilizados tres marcadores fenotipicos: cor de flor, formato do
apice da vagem e habito de crescimento. Foi possivel mapear 198 microssatelites e
os 3 marcadores fenotipicos. Dentre os marcadores mapeados, 131 tinham a
posicao ate entao desconhecida em grupos de ligacao. O mapa resultante cobre
1865.9 cM, com uma distancia media entre marcadores de 9.4 cM. A cobertura de
mapa e considerada de saturacao moderada e pode servir de base para o
mapeamento de outras caracteristicas fenotipicas e de QTLs.
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Abstract: The common bean breeding programs are meant to attend specific demands
of bean producers. A common bean genotype of commercial interest must present
desirable productivity characteristics; resistance to the main diseases and
technological quality, like cooking time, nutritional value and... Ver mais Abstract: The common bean breeding programs are meant to attend specific demands
of bean producers. A common bean genotype of commercial interest must present
desirable productivity characteristics; resistance to the main diseases and
technological quality, like cooking time, nutritional value and type of broth. The
choice of efficient criteria for identification of superiors inbred lines to be used in
crosses supports breeders work. Moreover, the use of genitors with higher genetic
potential increases the chances to reach more stable and productive cultivars, as
well as facilitates genotypes selection in competitive assays.
The common bean is one of the most important crops in Brazil and it has
potential to be explored, but, the current productivity is low and requires efforts to
improve the field performance. In this way, the search for molecular techniques
can be associated to assist the classic breeding, like to perform marker-assisted
selection. Microsatellites are repetitive sequences present in eukaryotes genomes,
transferable, and informative. The microsatellite markers are widely used in
genetic studies, and one of the main uses is to construct genetic maps.
The objective of the present work was to develop new microsatellite markers
to common bean and to construct a genetic map. Up to new 488 microsatellites
were developed, of which 183 are available in 3 articles about loci characterization
and, 64 are described in genetic map article. The remaining loci were
monomorphic for the genotypes used, and they will be described in an article too.
The genetic map was based on a mapping population F10, formed by 380
recombinant inbred lines derived of IAC-UNAF and CAL143 crosses. We tested 871
microssatellites, of which 265 (30,4%) were polymorphic and 247 (28,4%)
presented adequate genotyping standard. Beyond the molecular markers, weevaluated three phenotypic markers: flower color, pod tip shape, and growth habit.
It was possible to map 198 microssatellites and the 3 phenotypic markers.
Amongst the mapped microsatellite markers, 131 have never been located before
in any known linkage group. The resulting map covers a total of 1865.9 cM in
length and average distance between markers was 9.4 cM. The coverage of the
generated map is considered to have a moderate saturation, which makes it useful
for mapping other qualitative traits and QTLs.
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of bean producers. A common bean genotype of commercial interest must present
desirable productivity characteristics; resistance to the main diseases and
technological quality, like cooking time, nutritional value and... Ver mais Abstract: The common bean breeding programs are meant to attend specific demands
of bean producers. A common bean genotype of commercial interest must present
desirable productivity characteristics; resistance to the main diseases and
technological quality, like cooking time, nutritional value and type of broth. The
choice of efficient criteria for identification of superiors inbred lines to be used in
crosses supports breeders work. Moreover, the use of genitors with higher genetic
potential increases the chances to reach more stable and productive cultivars, as
well as facilitates genotypes selection in competitive assays.
The common bean is one of the most important crops in Brazil and it has
potential to be explored, but, the current productivity is low and requires efforts to
improve the field performance. In this way, the search for molecular techniques
can be associated to assist the classic breeding, like to perform marker-assisted
selection. Microsatellites are repetitive sequences present in eukaryotes genomes,
transferable, and informative. The microsatellite markers are widely used in
genetic studies, and one of the main uses is to construct genetic maps.
The objective of the present work was to develop new microsatellite markers
to common bean and to construct a genetic map. Up to new 488 microsatellites
were developed, of which 183 are available in 3 articles about loci characterization
and, 64 are described in genetic map article. The remaining loci were
monomorphic for the genotypes used, and they will be described in an article too.
The genetic map was based on a mapping population F10, formed by 380
recombinant inbred lines derived of IAC-UNAF and CAL143 crosses. We tested 871
microssatellites, of which 265 (30,4%) were polymorphic and 247 (28,4%)
presented adequate genotyping standard. Beyond the molecular markers, weevaluated three phenotypic markers: flower color, pod tip shape, and growth habit.
It was possible to map 198 microssatellites and the 3 phenotypic markers.
Amongst the mapped microsatellite markers, 131 have never been located before
in any known linkage group. The resulting map covers a total of 1865.9 cM in
length and average distance between markers was 9.4 cM. The coverage of the
generated map is considered to have a moderate saturation, which makes it useful
for mapping other qualitative traits and QTLs.
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Souza, Anete Pereira de, 1962-
Orientador
Benchimol-Reis, Luciana Lasry, 1970-
Coorientador
Zucchi, Maria Imaculada, 1971-
Avaliador
Van Sluys, Marie-Anne
Avaliador
Vincentz, Michel Georges Albert, 1958-
Avaliador
Carbonell, Sergio Augusto Morais
Avaliador
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