Variabilidade do gene G do virus repiratorio sicial humano (hRSV) e gene F do metapneumovirus humano (hMPV)
Luciana Helena Antoniassi da Silva
DISSERTAÇÃO
Português
(Broch.)
T/UNICAMP Si38v
[Genetic variability in the G gene of human respiratory syncytial virus (hRSV) and in the F gene of human metapneuvirus (hMPV)]
Campinas, SP : [s.n.], 2007.
78f. : il.
Orientador: Clarice Weis Arns
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas
Resumo: Os membros da família Paramyxoviridae, subfamília Pneumovirinae são vírus envelopados, não-segmentados dotados de genoma de RNA de fita simples com sentido negativo. O vírus Respiratório sincicial humano (hRSV) é o agente viral melhor caracterizado neste grupo, associado à doença do trato...
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Resumo: Os membros da família Paramyxoviridae, subfamília Pneumovirinae são vírus envelopados, não-segmentados dotados de genoma de RNA de fita simples com sentido negativo. O vírus Respiratório sincicial humano (hRSV) é o agente viral melhor caracterizado neste grupo, associado à doença do trato respiratório inferior. Recentemente foi identificado um novo patógeno humano pertencente à subfamília Pneumovirinae, o metapneumovírus humano (hMPV), o qual possui similaridades com o hRSV, na sua organização genômica, estrutura viral, antigenicidade e sintomas clínicos. Na primeira parte do presente trabalho o objetivo foi analisar a variabilidade genética dos isolados de hRSV circulantes na região de Campinas, no período de Abril a Setembro de 2004, comparando as seqüências previamente obtidas do gene que codifica as proteínas F e G do vírus com seqüências parciais e completas de gene homólogo de isolados identificados em outros países. A análise filogenética permitiu classificar os isolados de hRSV como pertencentes aos subgrupos A e B. Os isolados pertencentes ao subgrupo A se distribuíram em três genótipos: GA2, GA5 e SSA1. O genótipo SSA1 foi identificado pela primeira vez no sul da África, e existem poucos relatos do mesmo na literatura. As seqüências analisadas dos isolados do subgrupo B foram identificadas em 3 genótipos distintos dentro desse subgrupo, notadamente GB3 (SAB3) e BA (BAIII). Das amostras analisadas no presente estudo, duas foram identificadas como pertencentes ao genótipo BA, os isolados apresentaram a duplicação dos 60nt na posição 781-840 do gene. Na segunda parte da tese o objetivo foi identificar a presença e caracterizar molecularmente o hMPV por seqüenciamento parcial do gene que codifica para a proteína F de amostras coletadas de crianças em dois hospitais universitários na região de Campinas, São Paulo, Brasil. Com base nas seqüências de nucleotídeos do gene F do hMPV, foi identificada a presença do subgrupo B/genótipo B1 em nosso trabalho, semelhante ao que foi relatado em 2004 na Austrália. Nossas amostras apresentaram duas amostras variantes neste mesmo genótipo, com base nas seqüências de nucleotídeos
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Abstract: The members of the Paramyxoviridae are enveloped, non-segmented viruses, with negative-sense single stranded genomes. Respiratory syncytial virus (hRSV) is the best characterized agent viral of this group, associated with respiratory diseases in lower respiratory tract. Recently, a new...
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Abstract: The members of the Paramyxoviridae are enveloped, non-segmented viruses, with negative-sense single stranded genomes. Respiratory syncytial virus (hRSV) is the best characterized agent viral of this group, associated with respiratory diseases in lower respiratory tract. Recently, a new human pathogen belonging to the subfamily Pneumovirinae was identified, the human metapneumovirus (hMPV), which is structurally similar to the hRSV, in genomic organization, viral structure, antigenicity and clinical symptoms. In the first part of the present work the objective is to analyze the genetic variability hRSV isolates circulating in the region of Campinas, in the period April and September 2004, comparing previously obtained sequences from the F and G protein gene of such strains with other partial and complete gene sequences from the homologous genes from isolates identified in other countries. The phylogenetic analysis conducted here allowed us to allocate the isolates belonging to groups A and B. The isolates belonging to the group A showed three clusters, GA2, GA5 and SAA1. The genotype SSA1 was previously identified in South Africa, and there are few reports of such genotype it in the literature. Analyzed sequences belonging to group B were identified in three distinct clusters, GB3 (SAB3) and BA (BAIII). Of the analyzed sequences in the present study, two were identified as belonging to genotype BA the isolates showed 60 nucleotide (nt) duplication at positions 781-840 the gene. In the second part of the thesis the objective was to identify the presence and molecular characterization of hMPV by partially sequencing of the F protein gene in samples collected from children of two university hospitals in the region of Campinas, São Paulo state, Brazil. Based on nucleotide sequences of hMPV F gene, we identified the presence of subgroup B/genotype B1 in our work, similarly to reports in 2004 in Australia. Our samples showed to variants in the same genotype, based on nucleotides sequences
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Variabilidade do gene G do virus repiratorio sicial humano (hRSV) e gene F do metapneumovirus humano (hMPV)
Luciana Helena Antoniassi da Silva
Variabilidade do gene G do virus repiratorio sicial humano (hRSV) e gene F do metapneumovirus humano (hMPV)
Luciana Helena Antoniassi da Silva
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