Caracterização genomica de isolados brasileiros do herpesvirus equino do tipo 1
Rodrigo Franco de Carvalho
TESE
Português
(Broch.)
T/UNICAMP C253c
[Characterization of Brazilian isolates of equine herpesvirus type A]
Campinas, SP : [s.n.], 2005.
67p. : il.
Orientador: Clarice Weis Arns
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Resumo: O herpesvírus eqüino do tipo 1 (EHV-1) é um membro da subfamília Alfaherpesvirinae, implicado no surgimento de distúrbios respiratórios, reprodutivos e nervosos em cavalos. A principal forma de contaminação dos animais é através do contato direto com secreções contaminadas pelo vírus. No...
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Resumo: O herpesvírus eqüino do tipo 1 (EHV-1) é um membro da subfamília Alfaherpesvirinae, implicado no surgimento de distúrbios respiratórios, reprodutivos e nervosos em cavalos. A principal forma de contaminação dos animais é através do contato direto com secreções contaminadas pelo vírus. No eqüino, a disseminação do vírus ocorre pela transposição da infecção respiratória a outros órgãos e sistemas através da corrente sanguínea. Pouco se sabe sobre a ocorrência do EHV-1 no Brasil. Dessa forma, este estudo teve por objetivo o isolamento do EHV-1 a partir de material biológico e produção e análise de dados moleculares de isolados brasileiros de EHV-1. Durante este estudo, foi realizado o isolamento de uma amostra de EHV-1 a partir da inoculação de material clínico em células de derme eqüina (ED). Este isolado foi diagnosticado como EHV-1 através da reação em cadeia da polimerase (PCR) para o gene da timidina quinase (tk). Neste trabalho, foram também realizados os seqüenciamentos de fragmentos de PCR derivados do isolado aqui descrito, de uma outra amostra brasileira de EHV-1 e de duas amostras estrangeiras do vírus para análise filogenética. A análise comparativa entre seqüências permitiu inferências sobre o nível de divergência entre os vírus estudados, além da listagem de seqüências regulatórias para atividade gênica em um sítio do genoma localizado próximo ao gene tk. Na região genômica reportada foram contextualizadas ao menos três genes (ORF 38, ORF 37 e ORF 36). Os dados levantados com o seqüenciamento de amostras de EHV-1 de origens geográficas distintas (Brasil, Europa e América do Norte) não mostraram divergências, o que pode estar associado a um processo seletivo constritivo, que impediria a fixação de novas mutações naquela região. A ausência de divergências também pode estar associada à importância dessa região na regulação gênica do EHV-1. Também é um indicativo para a fidelidade dos mecanismos de replicação envolvidos na síntese do DNA viral, o que sugere a importância da região estudada na regulação da expressão gênica do EHV-1
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Abstract: Equine Herpesvirus Type 1 (EHV-1) is a member of Alphaherpesvirinae subfamily implicated with abortions, respiratory and neurological disturbs in horses. The principal mode of viral transmission is through close contact virus-containing secretions of infected horses. Systemic pathogenesis...
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Abstract: Equine Herpesvirus Type 1 (EHV-1) is a member of Alphaherpesvirinae subfamily implicated with abortions, respiratory and neurological disturbs in horses. The principal mode of viral transmission is through close contact virus-containing secretions of infected horses. Systemic pathogenesis in which this virus is implicated combines primary respiratory infection and spread of viral particles through the circulatory/lymphatic system. Until today, there are only few studies involving the isolation of this virus in Brazil. Thus, the main goal of this study was the isolation of EHV-1 from biological material and the production and analysis of molecular data derived from Brazilian EHV-1 isolates. Clinical samples were screened by inoculation into Equine Dermis (ED) cells monolayers, searching for the characteristic citopathic effect produced by EHV-1. Inoculation of one tissue sample has presented a suggestive citopathic effect. Re-inoculation of the original tissue homogenate in a second, independent experiment reproduced the same positive result. Following these observations, infection agent diagnostic was done by PCR for thymidine kinase (tk) gene. The results demonstrated that sample was EHV-1 positive. In this work, it was done either the sequencing of PCR fragments derived from two Brazilian and two foreign samples of EHV-1 for filogenetic and genomic analyses purposes. It was assigned at least three Open Reading Frames contexts (ORF 38, ORF 37, ORF 36). The data do not show genetic variation between sequences. The high level of genetic conservation for this region, despite the distinct geographic origins (Brazil, Europe and North America) of EHV-1 samples studied, indicates a strong selection process against the fixation of new mutations. It also highlights a high level of fidelity for DNA replication and strongly suggests the importance of the studied region for EHV-1 gene regulation
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Arns, Clarice Weis, 1956-
Orientador
Fernandes, Wilson Roberto
Avaliador
Costa, Sandra Cecília Botelho, 1951-
Avaliador
Pituco, Edviges Maristela
Avaliador
Maisonave, Jacqueline
Avaliador
Caracterização genomica de isolados brasileiros do herpesvirus equino do tipo 1
Rodrigo Franco de Carvalho
Caracterização genomica de isolados brasileiros do herpesvirus equino do tipo 1
Rodrigo Franco de Carvalho
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