Caracterização molecular e funcional de proteinas bZIPs de cana-de-açucar
Paulo Sergio Schlogl
TESE
Português
(Broch.)
T/UNICAMP Sch39c
Campinas, SP : [s.n.], 2004.
94f. : il.
Orientadores: Marcelo Menossi, Jorg Kobarg
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Resumo: Os fatores de transcrição bZIP ligam-se como dímeros a seqüências de DNA específicas presentes nas regiões promotoras, atuando como moduladores da expressão de vários genes em eucariotos. O conjunto completo e não redundante dos fatores de transcrição bZIP de Arabidopsis thaliana foi...
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Resumo: Os fatores de transcrição bZIP ligam-se como dímeros a seqüências de DNA específicas presentes nas regiões promotoras, atuando como moduladores da expressão de vários genes em eucariotos. O conjunto completo e não redundante dos fatores de transcrição bZIP de Arabidopsis thaliana foi agrupado em 13 sub-famílias filogenéticas. Essa classificação permitiu organizar 85 clusters de cana-de-açúcar que codificam bZIPs, obtidos no projeto SUCEST. As sub-famílias IV e XIII de A. thaliana não foram encontradas em cana de açúcar, provavelmente devido ao baixo nível de expressão destas sub-famílias em cana-de-açúcar. As análises filogenéticas com as bZIPs da sub-família Opaco2 suportam um modelo de evolução que envolve a duplicação de dois genes homólogos antes da separação das monocotiledôneas e dicotiledôneas. Expansões posteriores resultaram em três duplicações gênicas nas monocotiledôneas e uma nas plantas dicotiledôneas. Assim, a proteína Opaco2 provavelmente é o resultado de uma duplicação específica das plantas monocotiledoneas e representa uma especialização restrita a essas plantas. Uma proteína bZIP de cana-de-açúcar, SCbZIP I, foi clonada e caracterizada bioquimicamente. Ensaios de mobilidade eletroforética mostraram que a proteína SCbZIP I liga-se fortemente a sondas de DNA do tipo G-box, C-box e Hex. A fosforilação por CKII reduz sua afinidade pelo DNA. SCbZIP I foi capaz de produzir homodímeros e também heterodímeros com duas formas truncadas de Opac02. O gene é ativo nos estágios iniciais do desenvolvimento de plântulas, sendo expresso nas gemas laterais e também nas flores. o perfil de expressão dos 85 genes que codificam as bZIPs de cana-de-açúcar foi avaliado com maCrOaITanjos de DNA. Sete genes foram diferencialmente expressos durante o desenvolvimento de plântulas e outros oito foram modulados pelos hormônios ácido abscísico ou metil jasmonato
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Abstract: bZIP transcriptional factors bind as dimers to specific DNA targets present in the promoter regions of their target genes and act as modulators of gene expression in eukaryotes. The complete set of Arabidopsis thaliana bZIPs was grouped in thirteen phylogenetic sub-families. This...
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Abstract: bZIP transcriptional factors bind as dimers to specific DNA targets present in the promoter regions of their target genes and act as modulators of gene expression in eukaryotes. The complete set of Arabidopsis thaliana bZIPs was grouped in thirteen phylogenetic sub-families. This classification allowed the organization and identification of 85 sugarcane clusters from SUCEST project. Sub-families IV and XIII were not found in sugarcane, probably due to the low level of expression of these sub- families. Phylogenetic analysis of the Opaque2 subfamily support a model of evolution that involves a duplication of two homologues before the separation of monocot and dicot plants. Subsequent expansions resulted in three gene duplications in monocots and one in dicots. Opaque2 is probably the result of one specific duplication of monocots and represents a restrict specialization in these plants. A sugarcane bZIP, SCbZIPI was cloned and biochemically characterized. Electrophoretic mobility shift assays showed that SCbZIP I binds tightly to G- and C-boxes, Hex motifs, and phosphorylation of SCbZIPI by CKII decreases its DNA affinity. SCbZIPI underwent homodimerization and heterodimerization with truncated Opaque 2 from Coix. SCbZIPI mRNA is expressed in early stages of development and in lateral buds and flowers. The pattem of expression of 85 sugarcane bZIP genes was evaluated by cDNA arrays. Seven genes were differentially expressed during plantlet development and eight were modulated by Abscisic acid or Methyl-jasmonate
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Menossi, Marcelo, 1968-
Orientador
Kobarg, Jörg, 1965-
Coorientador
Maia, Ivan de Godoy
Avaliador
Ulian, Eugenio Cesar
Avaliador
Zanchin, Nilson Ivo Tonin, 1962-
Avaliador
Benedetti, Celso Eduardo, 1964-
Avaliador
Caracterização molecular e funcional de proteinas bZIPs de cana-de-açucar
Paulo Sergio Schlogl
Caracterização molecular e funcional de proteinas bZIPs de cana-de-açucar
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