Genômica populacional do inseto praga Spodoptera frugiperda no Brasil e Argentina
Tamylin Kaori Ishizuka
TESE
Inglês
T/UNICAMP Is36g
[Population genomics of the insect pest Spodoptera frugiperda in Brazil and Argentina]
Campinas, SP : [s.n.], 2023.
1 recurso online (87 p.) : il., digital, arquivo PDF.
Orientador: Maria Imaculada Zucchi
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Instituto de Biologia
Resumo: A Spodoptera frugiperda é um inseto praga que apresenta grande importância econômica para diversas culturas devido ao seu hábito polífago. Apesar de ser uma praga conhecida no continente americano, nos últimos anos ela foi introduzida em novos continentes e ganhou muita notoriedade pelo seu...
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Resumo: A Spodoptera frugiperda é um inseto praga que apresenta grande importância econômica para diversas culturas devido ao seu hábito polífago. Apesar de ser uma praga conhecida no continente americano, nos últimos anos ela foi introduzida em novos continentes e ganhou muita notoriedade pelo seu potencial de dano. No Brasil, populações resistentes a diversos inseticidas e proteínas Bt já foram reportadas, e o manejo desta praga é uma questão sempre atual. A espécie compreende duas raças que são morfologicamente idênticas, porém apresentam diferenças genéticas e ecológicas. Apesar de haver muitos estudos sobre essa espécie, ainda há dúvidas sobre a estruturação genética dessas populações na América do Sul. Devido à importância de se conhecer e monitorar a variabilidade genética de populações de insetos que são pragas agrícolas, o objetivo principal desse estudo foi esclarecer o nível de estruturação genética das populações dentro do Brasil e como essas populações se diferenciam das populações da Argentina. Primeiramente, utilizei sequências parciais do gene mitocondrial COI para caracterização da variabilidade genética, da estruturação de populações e da história demográfica. Além do COI, uma porção do éxon 4 do gene Tpi foi sequenciado para melhor identificação das raças a que pertenciam os indivíduos. Em seguida, através da metodologia de Genotyping-By-Sequencing (GBS), obtive milhares de marcadores SNPs do genoma nuclear para aumentar a resolução na caracterização da diversidade genética das populações. De forma geral, a análise de haplótipos com o COI não indicaram presença de clusters geográficos, enquanto o GBS indicou estruturação entre populações da Argentina e as do Brasil. Análises de FST par a par, tanto através do marcador mitocondrial quanto dos marcadores nucleares, indicaram estruturação genética entre as populações da Argentina. Os dois tipos de marcadores também evidenciaram fluxo gênico entre as populações do Brasil, e que estas estão estruturadas somente pela presença das duas raças. Este é o estudo mais abrangente no território nacional em termos de genética e genômica de populações de S. frugiperda, e as implicações dos resultados em termos práticos são discutidos
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Abstract: Spodoptera frugiperda is an insect pest that has great economic importance in several crops due to its polyphagous nature. Despite being a known pest in the American continent, in recent years it has been introduced into new continents and has gained much notoriety for its ability to cause...
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Abstract: Spodoptera frugiperda is an insect pest that has great economic importance in several crops due to its polyphagous nature. Despite being a known pest in the American continent, in recent years it has been introduced into new continents and has gained much notoriety for its ability to cause damage. In Brazil, populations resistant to several insecticides and Bt proteins have been reported, and the management of this pest is an ever-present issue. The species comprises two strains that are morphologically identical, however feature genetic and ecological differences. Although there are many studies on this species, genetic structure of these populations is still unclear in South America. Due to the importance of knowing and monitoring the genetic variability of insect populations that are agricultural pests, the main objective of this study was to clarify the level of genetic structure of populations within Brazil and how these populations differ from populations in Argentina. First, I used partial sequences of the mitochondrial COI gene to characterize genetic variability, population structure and demographic history. In addition to the COI marker, a portion of exon 4 of the Tpi gene was sequenced to better identify the strains of each individual. Then, through the Genotyping-By-Sequencing (GBS) methodology, I obtained thousands of SNP markers from the nuclear genome to increase resolution in the characterization of the genetic diversity of populations. In general, the analysis of COI haplotypes did not indicate the presence of geographic clusters, while the GBS indicated structuring between populations from Argentina and Brazil. Pairwise FST analyses, generated either by the mitochondrial or the nuclear markers, indicated genetic structure among populations within Argentina. The two types of markers also indicated presence of gene flow among the Brazilian populations, which are structured only by the presence of the two strains. This is the most comprehensive study in the national territory in terms of genetics and genomics of S. frugiperda populations, and the implications of the results in practical terms are discussed
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Aberto
Zucchi, Maria Imaculada, 1971-
Orientador
Almeida, Carlos Eduardo
Avaliador
Souza, Anete Pereira de, 1962-
Avaliador
Priolli, Regina Helena Geribello, 1963-
Avaliador
Pereira, Renata Ramos
Avaliador
Genômica populacional do inseto praga Spodoptera frugiperda no Brasil e Argentina
Tamylin Kaori Ishizuka
Genômica populacional do inseto praga Spodoptera frugiperda no Brasil e Argentina
Tamylin Kaori Ishizuka