Análise bioinformática de microRNAs circulantes relacionada ao câncer após lesão medular
Elisangela Cristina Pereira Lopes
DISSERTAÇÃO
Multilíngua
T/UNICAMP L881a
[Bioinformatics analysis of circulating microRNAs related to cancer following spinal cord injury]
Campinas, SP : [s.n.], 2020.
1 recurso online (43 p.) : il., digital, arquivo PDF.
Orientador: Roberto Schreiber
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas
Resumo: Indivíduos com lesão medular (LM) possuem maior pré-disposição a desenvolverem alguns tipos de câncer, entre eles o câncer de bexiga, câncer esofágico e câncer hematológico. Estudos apontam que a desregulação de microRNAs pode estar relacionada com o processo de carcinogênese. Nesse estudo...
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Resumo: Indivíduos com lesão medular (LM) possuem maior pré-disposição a desenvolverem alguns tipos de câncer, entre eles o câncer de bexiga, câncer esofágico e câncer hematológico. Estudos apontam que a desregulação de microRNAs pode estar relacionada com o processo de carcinogênese. Nesse estudo utilizando-se de ferramentas de bioinformática foram identificados os microRNAs e seus genes alvos relacionados aos três tipos mais frequentes de câncer em pacientes com LM, utilizando para isso os microRNAs diferencialmente expressos em pacientes com LM comparado com pacientes saudáveis em estudo prévio realizado pelo nosso grupo. O programa utilizado para a pesquisa dos microRNAs nas databases foi o MirWalk 2.0 e para criar a rede de interação microRNA gene alvo o software utilizado foi o CytoScape. Foram selecionados 23 microRNAs com expressão reduzida e 3 microRNAs com expressão aumentada em pacientes com LM. Associados ao câncer hematológico foram identificados 21 microRNAs com expressão reduzida e 3 microRNAs com expressão aumentada, os quais possuiam 69 genes alvo e 18 genes alvo respectivamente. Ao câncer de bexiga foram associados 19 microRNAs com expressão reduzida e 3 com expressão aumentada, possuindo 26 genes alvo nos microRNAs com expressão reduzida e 10 genes alvo nos microRNAs com expressão aumentada. Em relação ao câncer esofágico foi obtida associação com 20 microRNAs com expressão reduzida e 3 com expressão aumentada, onde há 24 genes alvo para os microRNAs de expressão reduzida e 15 genes alvo para os microRNAs de expressão aumentada. Dentre os microRNAs com expressão aumentada observamos três genes alvo comuns aos três tipos de câncer, sendo o MAPK1, MAPK3 e o TP53. Por sua vez, nos microRNAs com expressão reduzida foram encontrados também três genes alvo comuns aos três tipos de câncer, sendo o TP53, CCND1 e o KRAS. Nossa análise bioinformática conclui portanto, que há potencial influência de diversos microRNAs no desenvolvimento de câncer em paciente com LM
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Abstract: Individuals with spinal cord injury (SCI) are more likely to develop some types of cancer, including bladder cancer, esophageal cancer, and hematological cancer. Studies show that microRNA deregulation may be related to the process of carcinogenesis. In this study, by the bioinformatics...
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Abstract: Individuals with spinal cord injury (SCI) are more likely to develop some types of cancer, including bladder cancer, esophageal cancer, and hematological cancer. Studies show that microRNA deregulation may be related to the process of carcinogenesis. In this study, by the bioinformatics approach, microRNAs and their target genes related to the three most frequent types of cancer were identified in patients with SCI and compared to healthy patients from our previous study. The software used for researching microRNAs in databases was MirWalk 2.0 and to create the microRNA interaction network target gene was CytoScape. A total of 23 microRNAs with reduced expression and 3 with increased expression which had 69 target genes and 18 target genes respectively, were associated with hematological cancer. For bladder cancer, 19 microRNAs with reduced expression and 3 with increased expression, having 26 target genes, and 10 target genes respectively, were identified. Finally, we obtained an association with 20 microRNAs with reduced expression and 3 with increased expression, which had 24 target genes for microRNAs with reduced expression and 15 with increased expression for esophageal cancer. We found, among microRNAs with increased expression, three target genes that were common to the types of cancer, i.e., MAPK1, MAPK3, and TP53. In microRNAs with reduced expression, TP53, CCND1 and KRAS were described. We concluded a potential influence of several microRNAs on the development of cancer in SCI patient
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Análise bioinformática de microRNAs circulantes relacionada ao câncer após lesão medular
Elisangela Cristina Pereira Lopes
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Elisangela Cristina Pereira Lopes