Resumo: A mastite bovina é a doença que mais afeta a indústria leiteira no Brasil e no mundo. O gênero "Streptococcus" é considerado um dos principais responsáveis por desencadear tal doença nos rebanhos e "Aerococcus viridans" vem se mostrando uma espécie emergente dentro do âmbito da mastite. Além disso, a composição rica em nutrientes do leite bovino pode favorecer o desenvolvimento de comunidades bacterianas diversas. O objetivo do presente estudo foi avaliar e correlacionar a incidência de "Streptococcus" spp. e "Aerococcus viridans" em amostras de leites de vacas mastíticas e sadias provenientes de fazendas localizadas nas cinco regiões do Brasil, além de verificar e comparar a diversidade bacteriana presente em amostras de leite de tanque, considerando também as diferentes regiões do país, por meio do Sequenciamento de Nova Geração (NGS) do gene 16S rRNA. Do total de 1.447 amostras de leites coletadas nos estados de Santa Catarina, São Paulo, Goiás, Paraíba e Pará, 720 foram provenientes de vacas saudáveis (49,7%), 529 de vacas com mastite subclínica (36,6%) e 198 com mastite clínica (13,7%). Deste total, foram identificados 32 (2,2%) isolados confirmados de Streptococcus, sendo 16 (50%) S. agalactiae, dez (31,3%) S. uberis, cinco (15,6%) S. dysgalactiae e um (3,1%) S. equinus. O estado da Paraíba apresentou o maior número de isolados de Streptococcus spp. (22/32) e a espécie S. uberis foi identificada em todos os estados. Estreptomicina (19; 59,4%) e tetraciclina (16; 50%) foram os antimicrobianos com as maiores porcentagens de isolados resistentes e foram encontrados 11 (34,4%) isolados multirresistentes. Nove isolados de S. agalactiae foram sequenciados, todos advindos do estado da Paraíba por serem considerados multirresistentes. As análises de MLST identificaram dois tipos sequenciais: ST-67 e ST-103. Além disso, foi identificada a presença de quatro genes de resistência a antimicrobianos (ant(6)_Ia_3, tet(O)_3, mre(A)_1 e erm(B)_18) e 77 genes de virulência (acpC, bca, cap8J, carB, ccpA, cfa/cfb, ciaR, clpP, cpsABCDEFGKLY, csrRS, cydA, cylABDEFGIJKXZ, fba, fbsA, gbs1402, gbs1529, glnA, guaA, hasC, hylB, lepA, leuS, lgt, luxS, murF, neuABCD, pbp1A, pepCNX, psaC, purBHLN, rpoE, SAK_0517, scrB, sodA, SP_0095, SP_0121, SP_0320, SP_0494, SP_0829, SP_0856, SP_0943, SP_1396, SP_1398, SP_1399, SP_1544, SP_1847, SP_1970, vicK). Foram encontrados 15 (1%) isolados de Aerococcus viridans, a maioria considerados sensíveis aos antimicrobianos testados. Para o estudo do microbioma, 57 amostras de leite de tanque dos estados de Santa Catarina, São Paulo, Minas Gerais, Goiás, Maranhão, Pará e Tocantins foram sequenciadas por metagenômica a partir de NGS. Moraxellaceae (22,3%), Streptococcaceae (14,1%), Acetobacteraceae (13,8%), Pseudomonadaceae (11,0%) e Enterococcaceae (9,0%) foram as principais famílias. Acinetobacter (22,3%), Pseudomonas (11,7%) e Acetobacter (8,1%) foram os principais gêneros. Os resultados obtidos reforçaram os potenciais patogênicos do gênero "Streptococcus" sp. e da espécie "Aerococcus viridans" como responsáveis por desencadear mastite em bovinos de leite. Além disso, o rastreamento de bactérias em leite de tanque permitiu traçar as melhores estratégias de prevenção e controle das contaminações Ver menos

Abstract: Bovine mastitis is the disease that most affects the dairy industry in Brazil and the world. The genus "Streptococcus" is considered one of the main responsible for triggering this disease in livestock and "Aerococcus viridans" has been shown to be an emerging species within the scope of mastitis. Furthermore, the nutrient-rich composition of bovine milk can favor the development of diverse bacterial communities. The objective of the present study was to evaluate and correlate the incidence of "Streptococcus" spp. and "Aerococcus viridans" in milk samples from mastitic and healthy cows from farms located in the five regions of Brazil, in addition to verifying and comparing the bacterial diversity present in milk tank samples, also considering the different regions of the country, through Next Generation Sequencing (NGS) of the 16S rRNA gene. Of the total of 1,447 milk samples collected in the states of Santa Catarina, São Paulo, Goiás, Paraíba and Pará, 720 came from healthy cows (49.7%), 529 from cows with subclinical mastitis (36.6%) and 198 with clinical mastitis (13.7%). Of this total, 32 (2.2%) confirmed Streptococcus isolates were identified, 16 (50%) being S. agalactiae, ten (31.3%) S. uberis, five (15.6%) S. dysgalactiae and one (3.1%) S. equinus. The state of Paraíba presented the highest number of Streptococcus spp. isolates. (22/32) and the species S. uberis was identified in all states. Streptomycin (19; 59.4%) and tetracycline (16; 50%) were the antimicrobials with the highest percentages of resistance and 11 (34.4%) multidrug-resistant isolates were found. Nine isolates of S. agalactiae were sequenced, all from the state of Paraíba as they were considered multi-resistant. MLST analyzes identified two sequence types: ST-67 and ST-103. Furthermore, the presence of four antimicrobial resistance genes (ant(6)_Ia_3, tet(O)_3, mre(A)_1 and erm(B)_18) and 77 virulence genes (acpC, bca, cap8J , carB, ccpA, cfa/cfb, ciaR, clpP, cpsABCDEFGKLY, csrRS, cydA, cylABDEFGIJKXZ, fba, fbsA, gbs1402, gbs1529, glnA, guaA, hasC, hylB, lepA, leuS, lgt, luxS, murF, neuABCD, pbp1A , pepCNX, psaC, purBHLN, rpoE, SAK_0517, scrB, sodA, SP_0095, SP_0121, SP_0320, SP_0494, SP_0829, SP_0856, SP_0943, SP_1396, SP_1398, SP_1399, SP_1544, SP_1847, SP_1 970, vicK) were detected. A total of 15 (1%) isolates of Aerococcus viridans were found, most of which were considered sensitive to the antimicrobials tested. For the microbiome study, 57 milk tank samples from the states of Santa Catarina, São Paulo, Minas Gerais, Goiás, Maranhão, Pará and Tocantins were sequenced by metagenomics using NGS. Moraxellaceae (22.3%), Streptococcaceae (14.1%), Acetobacteraceae (13.8%), Pseudomonadaceae (11.0%) and Enterococcaceae (9.0%) were the main families. Acinetobacter (22.3%), Pseudomonas (11.7%) and Acetobacter (8.1%) were the main genera. The results obtained reinforced the pathogenic potential of the genus "Streptococcus" sp. and the species "Aerococcus viridans" as responsible for triggering mastitis in dairy cattle. Furthermore, tracking bacteria in milk tank made it possible to trace the best strategies for preventing and controlling contamination Ver menos