Genômica da conservação de Casearia sylvestris Sw. no Cerrado e Mata Atlântica do Estado de São Paulo [recurso eletrônico] = Conservation genomics of Casearia sylvestris Sw. in the Brazilian Savannah and Atlantic Forest of the State of São Paulo
João Paulo Gomes Viana
TESE
Inglês
T/UNICAMP V654g
[Conservation genomics of Casearia sylvestris Sw. in the Brazilian Savannah and Atlantic Forest of the State of São Paulo]
Campinas, SP : [s.n.], 2017.
1 recurso online (86 p.) : il., digital, arquivo PDF.
Orientador: Maria Imaculada Zucchi
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Resumo: As restaurações florestais e o estabelecimento de unidades de conservação têm sido os principais meios para a conservação dos biomas Cerrado e Mata Atlântica no Brasil mas pouca atenção tem sido dada à diversidade genética nas populações de espécies vegetais destas áreas. Por isso,...
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Resumo: As restaurações florestais e o estabelecimento de unidades de conservação têm sido os principais meios para a conservação dos biomas Cerrado e Mata Atlântica no Brasil mas pouca atenção tem sido dada à diversidade genética nas populações de espécies vegetais destas áreas. Por isso, realizou-se dois estudos com os objetivos de: 1) Avaliar a diversidade e estruturação genética de Casearia sylvestris Sw. em restaurações florestais e em remanescentes naturais de Mata Atlântica; 2) Estudar a diversidade e estruturação genética de populações naturais de C. sylvestris do Cerrado e Mata Atlântica do Brasil e verificar a ocorrência de seleção positiva nestas populações. Construiram-se e foram sequenciadas bibliotecas genômicas da espécie C. sylvestris Sw. utilizando as técnicas de genotyping-by-sequencing (GBS) e double-digested restriction associated DNA (ddRADseq). Calcularam-se estimativas de diversidade e diferenciação genética para todas as populações (número total de alelos, heterozigosidades, número de alelos privados, riqueza alélica, coeficientes de endogamia e índices de fixação) e o estudo de estruturação genética foi realizado através da análise discriminante de componentes principais (DAPC). Não houveram diferenças significativas entre as estimativas de diversidade e diferenciação genética calculadas no primeiro estudo indicando que as restaurações florestais têm oferecido condições de conservação da diversidade genética. No segundo estudo foi observado que as populações de C. sylvestris do Cerrado e Mata Atlântica estão geneticamente estruturadas. Além disso, relatou-se ineditamente a ocorrência de seleção positiva nas populações destes biomas. Conclui-se com estes dois estudos que o modelo o qual as restaurações florestais foram implementadas no Brasil tem possibilitado a conservação da diversidade genética das populações e que as diferenças nas características ambientais entre o Cerrado e Mata Atlântica podem levar a ocorrência de eventos microevolutivos que levam a adaptação local a estes biomas
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Abstract: Forest restorations and conservation units have been the main ways for the conservation of Brazilian Savannah (Cerrado) and Atlantic Forest biomes in Brazil, but little attention has been given to genetic diversity in the populations of plant species of these areas. Therefore, two studies...
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Abstract: Forest restorations and conservation units have been the main ways for the conservation of Brazilian Savannah (Cerrado) and Atlantic Forest biomes in Brazil, but little attention has been given to genetic diversity in the populations of plant species of these areas. Therefore, two studies were carried out with the objectives of: 1) Evaluate the genetic diversity and structure of Casearia sylvestris Sw. In forest restorations and in natural remnants of Atlantic Forest; 2) Study the genetic diversity and structure of natural populations of C. sylvestris from the Cerrado and Atlantic Forest of Brazil and verify the occurrence of positive selection in these populations. Genomic libraries of C. sylvestris were built and sequenced using genotyping-by-sequencing (GBS) and double-digested restriction associated DNA (ddRADseq) techniques. Estimates of genetic diversity and differentiation were estimated for all populations (total number of alleles, heterozygosities, number of private alleles, allelic richness, inbreeding coefficients and fixation indices) and the genetic structuring study was performed through the discriminant analysis of components (DAPC). There were no significant differences between the estimates of diversity and genetic differentiation calculated in the first study, indicating that forest restorations have offered conservation conditions of genetic diversity. In the second study it was observed that the populations of C. sylvestris from Cerrado and Atlantic Forest are genetically structured. In addition, the occurrence of positive selection in the populations of these biomes was reported. It is concluded with these two studies that the model that the forest restorations were implemented in Brazil has made possible the conservation of the genetic diversity of the populations and that the differences in the environmental characteristics between the Cerrado and Atlantic Forest can lead to the occurrence of microevolutionary events that lead local adaptation to these biomes
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Requisitos do sistema: Software para leitura de arquivo em PDF
Zucchi, Maria Imaculada, 1971-
Orientador
Mori, Gustavo Maruyama, 1986-
Avaliador
Martins, Karina
Avaliador
Laborda, Prianda Rios, 1979-
Avaliador
Nery, Mariana Freitas, 1983-
Avaliador
Genômica da conservação de Casearia sylvestris Sw. no Cerrado e Mata Atlântica do Estado de São Paulo [recurso eletrônico] = Conservation genomics of Casearia sylvestris Sw. in the Brazilian Savannah and Atlantic Forest of the State of São Paulo
João Paulo Gomes Viana
Genômica da conservação de Casearia sylvestris Sw. no Cerrado e Mata Atlântica do Estado de São Paulo [recurso eletrônico] = Conservation genomics of Casearia sylvestris Sw. in the Brazilian Savannah and Atlantic Forest of the State of São Paulo
João Paulo Gomes Viana